- 학력

B.S.1998 – 2006 서강대학교 컴퓨터공학과/생명과학과

M.S. 2006 – 2009 서강대학교 생명과학과

Ph.D. 2012 – 2019 서강대학교 생명과학과

- 경력

2019 - 현재 : ㈜신테카바이오

- 개설강의

바이오데이타분석학 (대학원)

- 연구분야

<인공지능을 이용한 단백질 구조 분석 및 신약 개발 연구>

단백질은 생명 현상을 조절하는 핵심 분자로, 질병 치료를 위한 표적이 되는 경우가 많습니다. 단백질의 구조를 정확히 파악하면 신약 개발 과정에서 약물이 단백질과 어떻게 결합하는지를 예측할 수 있어 효과적인 치료제 개발이 가능해집니다. 최근에는 인공지능(AI)을 활용하여 단백질 구조를 분석하고 신약 후보 물질을 찾는 연구가 활발히 진행되고 있습니다. 신약 개발은 일반적으로 10~15년이 걸리는 고비용, 고위험의 과정입니다. AI는 이를 획기적으로 단축할 수 있습니다.

본 연구에서는 AI를 활용하여 질병과 관련된 단백질 구조를 예측하고, 약물 결합 부위를 분석합니다. 그리고 가상 스크리닝 (Virtual Screening) 방식으로 수백만 개의 화합물을 AI로 빠르게 분석하여 단백질과 결합할 가능성이 높은 신약 후보 물질을 선별합니다. 또한 머신러닝 알고리즘을 이용하여 약물과 단백질 간의 결합 친화도를 평가하고 분자 동역학 시뮬레이션과 결합하여 보다 정밀한 예측을 하고자 합니다.

- 연구업적

Lee AR, Lee S, Shin JY, Kim JY, Moon KS, Jung J. Biomarker LEPRE1 induces pelitinib-specific drug responsiveness by regulating ABCG2 expression and tumor transition states in human leukemia and lung cancer. Sci Rep. 2022 Feb 21;12(1):2928.

Jeong H, Shin JY, Lee K, Lee SJ, Chong HJ, Jeong H, Jeon YE, Shin DS, Jang S, Kim KH, Kim SI, Lee YS, Ju BG. Caffeoyl-Prolyl-Histidine Amide Inhibits Fyn and Alleviates Atopic Dermatitis-Like Phenotypes via Suppression of NF-κB Activation. Int J Mol Sci. 2020 Sep 28;21(19):7160.

Gwak J, Jeong H, Lee K, Shin JY, Sim T, Na J, Kim J, Ju BG. SFMBT2-Mediated Infiltration of Preadipocytes and TAMs in Prostate Cancer. Cancers (Basel). 2020 Sep 22;12(9):2718.

Shin JY, Son J, Kim WS, Gwak J, Ju BG. Jmjd6a regulates GSK3β RNA splicing in Xenopus laevis eye development. PLoS One. 2019 Jul 30;14(7):e0219800.

Jeong H, Shin JY, Kim MJ, Na J, Ju BG. Activation of Aryl Hydrocarbon Receptor Negatively Regulates Thymic Stromal Lymphopoietin Gene Expression via Protein Kinase Cδ-p300-NF-κB Pathway in Keratinocytes under Inflammatory Conditions. J Invest Dermatol. 2019 May;139(5):1098-1109.

Na J, Shin JY, Jeong H, Lee JY, Kim BJ, Kim WS, Yune TY, Ju BG. JMJD3 and NF-κB-dependent activation of Notch1 gene is required for keratinocyte migration during skin wound healing. Sci Rep. 2017 Jul 26;7(1):6494.

Na W, Shin JY, Lee JY, Jeong S, Kim WS, Yune TY, Ju BG. Dexamethasone suppresses JMJD3 gene activation via a putative negative glucocorticoid response element and maintains integrity of tight junctions in brain microvascular endothelial cells. J Cereb Blood Flow Metab. 2017 Dec;37(12):3695-3708.

Gwak J, Shin JY, Lee K, Hong SK, Oh S, Goh SH, Kim WS, Ju BG. SFMBT2 (Scm-like with four mbt domains 2) negatively regulates cell migration and invasion in prostate cancer cells. Oncotarget. 2016 Jul 26;7(30):48250-48264.

Na J, Lee K, Na W, Shin JY, Lee MJ, Yune TY, Lee HK, Jung HS, Kim WS, Ju BG. Histone H3K27 Demethylase JMJD3 in Cooperation with NF-κB Regulates Keratinocyte Wound Healing. J Invest Dermatol. 2016 Apr;136(4):847-858.

Kim YJ, Bahn M, Kim YH, Shin JY, Cheong SW, Ju BG, Kim WS, Yeo CY. Xenopus laevis FGF receptor substrate 3 (XFrs3) is important for eye development and mediates Pax6 expression in lens placode through its Shp2-binding sites. Dev Biol. 2015 Jan 1;397(1):129-39.

Na J, Lee K, Kim HG, Shin JY, Na W, Jeong H, Lee JW, Cho S, Kim WS, Ju BG. Role of type II protein arginine methyltransferase 5 in the regulation of Circadian Per1 gene. PLoS One. 2012;7(10):e48152.

Kim YH, Shin JY, Na W, Kim J, Ju BG, Kim WS. Regulation of XFGF8 gene expression through SRY (sex-determining region Y)-box 2 in developing Xenopus embryos. Reprod Fertil Dev. 2012;24(6):769-77.

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